Во Вторую мировую войну Шкирпа в статусе дипломата работал в Берлине до краха режима Антанаса Сметоны. Из столицы рейха он формировал Литовский фронт активистов (ЛФА) — фашистскую организацию, исповедовавшую литовский вариант гитлеровской идеологии.
Организация также ратовала за уничтожение в Литве евреев, сообщило Радио Голос Балтии.
С лета 1941 года ЛФА стал главным подельником оккупационной немецкой армии в уничтожении населения.